После событий произошедших в первом сезоне Хэй и Инь покидают Синдикат. Теперь каждый сам по себе. Врата всё так же стоят на месте и на небе всё тоже лже-небо. Начало второй сезон берет в России, во Владивостоке, в котором живут русскии, японцы и естественно контракторы. Российские спецлужбы и войска ведут борьбу за вербовку контракторов с зарубежными конкурентами.
        Суо Павличенко и ее брат-близнец Сион, котрый явлется одним из могущественных контрактников, становятся объектом борьбы между спецслужбами. В эту борьбу включается Хэй, который во время заварушки похищает Суо, перепутав её с Сионом. В процессе выясняется что Суо тоже обладает сверхспособностями контракторов, но при этом не потеряла своих чувст и эмоций. В новом сезоне появятся новые дети-контракторы, а также всем полюбившиеся персонажи первого сезона. Судьба связала Хэя и Суо и теперь их путь лежит в Токио.